柬埔寨内河航运以湄公河、洞里萨湖为主，主要河港有金边、磅湛和磅清扬。雨季4000吨轮船可沿湄公河上溯至金边，旱季可通航2000吨货轮。金边和暹粒之间有客运船只运营。西哈努克港为国际港口。