马达加斯加医疗条件相对较差，医院设施简陋。截至2010年，马共有各类主要医疗机构3183家，其中基层卫生中心3015个，县级医院132所，地区级以上医院36所。大部分地区缺医少药，尤其是偏远乡村。在首都，陆军医院和个别外国诊所医疗条件较好，但费用较高，普通百姓不敢问津。中国侨民习惯自备少量常用药品，生病可去中国医疗队治疗，也可选择回国或第三国就医。在首都有马达加斯加国立救治中心、马达加斯加国立陆军医院，以及妇幼保健、综合医院等各类私立医院10多所。

由于马医疗卫生条件落后，非洲大陆一些流行病，如鼠疫、疟疾、登革热、阿米巴痢疾等在马也常见。目前尚无具体预防措施。

中国医疗队：中国政府自1975年8月起向马达加斯加派遣医疗队。截至2016年4月，中国共向马达加斯加派出20批医疗队，共计594人次。主要科室有内科、外科、妇产科、骨科、耳鼻喉科、麻醉科、针灸科和检验科等。目前，中国第20批医疗队共30人分布在马达加斯加4个条件比较艰苦的地区医院工作。

（1）马义奇县医院：12人。首都点，距首都约50公里。电话：0321108888

（2）昂布翁贝医院：7人。南方点，距首都约1300公里，电话：0321158885

（3）桑巴瓦医院：7人。北方点，距首都约1100公里，电话：0321168886

（4）瓦图曼德里医院：4人。东方点，距首都约500公里,电话：0321111888