中国与秘鲁尚未开通直达航线，前往秘鲁须途径美国（纽约、洛杉矶）、荷兰（阿姆斯特丹）、法国（巴黎）、西班牙（马德里）等国中转。秘国内航线丰富，出行方便。LATAM、TACA等公司国内航班声誉较好。

位于利马市郊卡亚俄区的豪尔赫·查韦斯国际机场（Aeropuerto Internacional de Jorge Chavez）是秘鲁主要国际航空港。往返机场可搭乘出租车或旅游包车，另有Avis、Hertz等公司提供租车服务。

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